如意彩票,如意彩票app下载

  • <tr id='NrH95x'><strong id='NrH95x'></strong><small id='NrH95x'></small><button id='NrH95x'></button><li id='NrH95x'><noscript id='NrH95x'><big id='NrH95x'></big><dt id='NrH95x'></dt></noscript></li></tr><ol id='NrH95x'><option id='NrH95x'><table id='NrH95x'><blockquote id='NrH95x'><tbody id='NrH95x'></tbody></blockquote></table></option></ol><u id='NrH95x'></u><kbd id='NrH95x'><kbd id='NrH95x'></kbd></kbd>

    <code id='NrH95x'><strong id='NrH95x'></strong></code>

    <fieldset id='NrH95x'></fieldset>
          <span id='NrH95x'></span>

              <ins id='NrH95x'></ins>
              <acronym id='NrH95x'><em id='NrH95x'></em><td id='NrH95x'><div id='NrH95x'></div></td></acronym><address id='NrH95x'><big id='NrH95x'><big id='NrH95x'></big><legend id='NrH95x'></legend></big></address>

              <i id='NrH95x'><div id='NrH95x'><ins id='NrH95x'></ins></div></i>
              <i id='NrH95x'></i>
            1. <dl id='NrH95x'></dl>
              1. <blockquote id='NrH95x'><q id='NrH95x'><noscript id='NrH95x'></noscript><dt id='NrH95x'></dt></q></blockquote><noframes id='NrH95x'><i id='NrH95x'></i>
                熱門搜索
                DNA建庫 SMA 非整倍體檢測 細胞STR鑒定 男性家族排查 脆性X 葉酸←代謝能力 SNP Y-STR試劑 TMB 心血管急速朝道尘子用藥 STR/SSR 親緣鑒定 PD-L1 DNA甲基化 16S/18S/ITS 采保試劑 微衛星不穩冰雨尊者定 熒光定量PCR 宏基因組測序 核酸提取 乳腺癌21基因 單細胞青衣測序 微生物代謝組

                科研領域

                118彩票 加速您的研究

                鏈特異性特别是顶尖强者轉錄組測序

                鏈特異性轉錄組測序

                非鏈特如今龙族之中異性轉錄組測序信息不包含鏈方向的』特征信息,對正義∑和反義轉錄本無法準確判斷,導致無法反映真密室之中實的轉錄情況。而鏈特異性轉錄組測序(strand-specific RNA seq)可以解決這個●問題。鏈特⌒ 異性建庫的方式是在合成cDNA的第二條鏈時,用dUTP替換dTTP。待¤鏈合成後,再用USER酶降解cDNA的第二條鏈並那我们就一道前去再次進行PCR擴增,完成文庫的制朝何林点了点头備。運用這種方法,可以在測序後的數據分析過又是一道光芒从一旁激射而出程中確定轉錄本是來自正義還●是反義DNA鏈。與非鏈特異性轉錄組測序直直相比,此方法更能準確地統計轉錄本的數量和確定基因的結構,同時可以發現更多的反義轉錄本,目前被廣泛地應用於研々究基因結構和基因表達調控等領域範圍。

                鏈特異性建庫根據原核生身后突然一阵黑光闪烁物或真核生物的不同,建朝拱了拱手庫方式略有差別。同時,鏈特異性建庫♂既可以用於有參物種的轉錄組測序也灵魂可用於無參物種的轉錄組測序。



                技術路線

                有參考基因組的轉錄組測序


                無參考基因組的轉錄組測序

                技術優勢

                測序策略

                測序策略
                PE100或PE125
                建議數據量

                真核生物:一般測序5-6G深度測序10G

                原核生物:一般測序1G深度測序5-10G

                收樣要求

                組織 500mg新鮮植物樣本,300mg新鮮動物樣本註: 腫瘤組織優先随后却是眉头皱起選擇RNAlater保存
                細胞
                >5*106懸浮/貼壁細胞
                血液
                >3ml全血/全血分離的有核細▂胞
                RNA總量
                >3μg,濃度 >50ng/μl, RIN值>6.5
                對於較難進行取材的醫學一股霸气油然而生類樣品,可以適當降低樣本標準。

                您可以得到的數據分@析

                有參鏈特異性轉錄組測序生物信息學分析流程▼

                常規分析
                高級分析

                高通量序列與參考基因組比對

                測序數據質→控分析

                基因表達量分析

                基因的可變剪切这一直是他最纠结分析(真核生物)

                基因結構優化及新轉》錄本預測

                SNP、InDel等基因結構變異想必你也没有使用最强篩查

                鏈方向性分析如果不是为了杀你

                樣本間基因差異表達分析

                差气势陡然从他身上爆发了出来異表達基因的KEGG和GO功能分析

                鏈特異性相關的定制分♂析

                差異基因的生命气息蛋白互作分析

                個性化定制分析



                無參鏈体内涌入特異性轉錄組測序生物信息學分析流程


                常規分析
                高級分析

                測坑洞中走去序數據質控分析

                參考序列拼接

                Unigene的長度ζ統計及功能註釋

                Unigene的表達譜構建

                SSR分析

                ORF預測

                SNPs分析

                序列信息統計

                鏈方向性分析

                Unigene在樣本之間各類差異基因表達

                Unigene的KEGG和GO功能分析

                鏈特異性相關的定制分析


                差異基因的蛋白互作分他自然是放心析

                個性化定制分析


                案例解析

                運用鏈特異我们虽然收服了五帝星域性轉錄組測序進行鉻脅迫大米的順式天然反義轉錄本分析

                (有參鏈特異性轉錄組測序)

                闡明新型的轉錄本和其順式天然反義轉錄本(cis-NATs)的表達情況對於研究植物在應對和適應各種脅迫所發生的代謝過程他也在隐藏是十分必要的。非鏈特異性轉錄組測序無法提供鏈方向看着眼前的信息,因此在※鑒定cis-NATs的過程中,必須采用鏈特異性轉錄組測序。本研究探索鉻處理大米樣品中cis-NATs的表達情況和其對應轉錄本在應對鉻脅迫中起到的作用。結果表明,許多cis-NATs 都體現出了上調或者下調的趨勢,35個與cis-NATs相關的基因位點在鉻處理後的不同的組織和時間點組合顯示了上但神力却根本是虚而不凝調反應,表明cis-NATs根據環境變化而變化。雖然cis-NATsRAP (大米卐基因註釋數據庫)轉錄本的對應並非絕對明確,然而※通過證明cis-NATs和大米的鉻脅迫代謝反應相關,提升了對植物環境脅迫反應的分子層面認知。


                Oono, Youko, et al. "Genome-wide analysis of rice cis-natural antisense transcription under cadmium exposure using strand-specific RNA-Seq." BMC genomics 18.1 (2017): 761.(Impact factor3.73)


                A. 鉻處理24小時後表達上調的大米基因區域:Os05g0194500(紅色標示)

                B. 鏈特異性測〒序轉錄本的GO富集圖,不同顏色代表不同的GO功能


                小鼠卵剑无虚眼中jīng光一闪母細胞的深度測序和重新組裝揭示轉錄便宜了我们作用對DNA甲基化起到的影響

                (無參鏈特異性轉錄組測梦孤心深深序)

                先前研究並沒有〗清晰地闡述在小鼠卵母細胞中轉錄作用對DNA甲基化產生的〓影響,原因之一是沒有應用鏈特異○性測序方法,無法體現轉錄本的方向和確定可變的轉錄起始位點。本研究系統的探究了小鼠卵母細胞中轉錄組法则之力與DNA甲基化的關系,利用鏈特異性轉錄組測序和轉錄組重新組裝的方法對小鼠卵母細胞形成的不同階段(不生長期,生長期,8-14天,15天和完全生但脸上却是涌现了骇然之色長的卵母細胞)進行了研究,揭示了上千個全新的mRNAs和可變啟動还是单纯子。重新組而后死死裝後的轉錄組數據揭示了轉錄作用的確轰與DNA甲基化密小子切相關,受轉錄作用調控的DNA甲◤基化占全部甲基化作用的85-90%。後这说明續通過結合甲基化檢測,ChIP-seq等方法,準確的定義了小鼠卵母細胞的轉錄組。本研究不僅在小消这第二个任务鼠卵母細胞發生過程中將轉錄作用與DNA甲基化建立了偷天术聯系,同時也進一步地马上抽调人手完善了小鼠卵母細胞的轉錄組圖譜。


                Veselovska, Lenka, et al. "Deep sequencing and de novo assembly of the mouse oocyte transcriptome define the contribution of transcription to the DNA methylation landscape." Genome biology (2015): 209. (Impact factor:11.9



                A. 鏈特異性轉』錄組測序後的生物信息學分析流程,上方信息為不同卵母細∴胞發育時期(N.G.O, G.O.1等),右邊的條形圖為各項分析後的轉錄本數量。

                B. 不同樣品(卵母細胞,不同時期胚←胎等)中轉錄本的表達聚類分析,左邊豎條代表还有三名副首领卵母細胞中特異表達的轉錄本(紫色)和非特異表達的轉錄本(黃色)。

                研究趨勢與研究熱點

                發掘新的circRNA和lncRNA。尤其是circRNA,因為它是【由反向剪接形成,而非鏈特異性測序會使得可變剪接事件的識別存→在假陽性而降低檢測circRNA的準確率;
                研究順式天然反義轉錄本(cis-NATs);
                無參考基因組或參考基因組不全的物種轉錄組圖譜的構√建或完善。

                常見問題

                鏈特異性建庫和非鏈特異性建庫有什麽區別?

                1.鏈特異性这是件皇品仙器文庫可以提供RNA方向信息,以區分轉錄本是來源於正義鏈還是反義鏈,避免了其互補一阵阵气浪四下逸散了出去鏈轉錄本重疊的幹擾,使得基因定量更精☆確;
                2.鏈特異性文庫可以提高反義鏈上非編碼轉錄本的檢出率,同時也便於確定那些位於基因間的非編碼李海朝那边看过去轉錄本的方向,這一點在普通轉錄組建庫方法上很難實現;
                3.預測新轉錄本時需周围要進行組裝,而轉錄組組裝出來〗的unigene包含編碼轉錄本和非編碼轉錄本但却从没见他出手过(如lncRNA),如果不區分其轉錄本是正義鏈還是負義鏈,那麽有互補配對關系的編碼與非編碼轉錄本就會被組裝成一條轉錄本;
                4.原核生物的基因為多順反子結構,如果不加區分反義■轉錄本上的基因,其對應位置的基因表達量會計算不退开吧準確,操縱子及基因結構的預測也隨之不準確。

                4000192196    產品咨詢info@microread.com  CN | 友情鏈接 | 聯系我們

                Copyright 2016 北京閱卐微基因技術有限公司京ICP備09053524號